MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR11

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014026	AGA	2	6	283	288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294508903
2	NC_014026	CAC	2	6	289	294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294508903
3	NC_014026	CGC	2	6	312	317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508903
4	NC_014026	GCG	2	6	323	328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508903
5	NC_014026	GTG	2	6	387	392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294508903
6	NC_014026	GCCC	2	8	418	425	0 %	0 %	25 %	75 %	294508903
7	NC_014026	CCG	2	6	457	462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508903
8	NC_014026	AGG	2	6	532	537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294508903
9	NC_014026	GGC	2	6	545	550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508903
10	NC_014026	GAG	2	6	638	643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294508904
11	NC_014026	CG	3	6	649	654	0 %	0 %	50 %	50 %	294508904
12	NC_014026	ATG	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294508904
13	NC_014026	ACC	2	6	705	710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294508904
14	NC_014026	GTT	2	6	716	721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294508904
15	NC_014026	AATC	2	8	750	757	50 %	25 %	0 %	25 %	294508904
16	NC_014026	GAG	2	6	809	814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294508904
17	NC_014026	GAG	2	6	845	850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294508904
18	NC_014026	CCG	2	6	901	906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508904
19	NC_014026	ATGG	2	8	924	931	25 %	25 %	50 %	0 %	294508904
20	NC_014026	AGC	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508904
21	NC_014026	CGT	2	6	1039	1044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294508904
22	NC_014026	TCG	2	6	1050	1055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294508904
23	NC_014026	GCA	2	6	1113	1118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508904
24	NC_014026	TTG	2	6	1257	1262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294508904
25	NC_014026	TGG	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294508904
26	NC_014026	AGA	2	6	1390	1395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294508904
27	NC_014026	ACCG	2	8	1399	1406	25 %	0 %	25 %	50 %	294508904
28	NC_014026	GAC	2	6	1448	1453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508904
29	NC_014026	GA	3	6	1518	1523	50 %	0 %	50 %	0 %	294508904
30	NC_014026	CGG	2	6	1570	1575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508904
31	NC_014026	CTA	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294508904
32	NC_014026	CGG	2	6	1687	1692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508904
33	NC_014026	CCGAT	2	10	1783	1792	20 %	20 %	20 %	40 %	294508904
34	NC_014026	AGG	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294508904
35	NC_014026	CTGC	2	8	1897	1904	0 %	25 %	25 %	50 %	294508904
36	NC_014026	CAG	2	6	2100	2105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508904
37	NC_014026	TCC	2	6	2106	2111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294508904
38	NC_014026	GTG	2	6	2135	2140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294508904
39	NC_014026	CGA	3	9	2245	2253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508904
40	NC_014026	CGG	2	6	2264	2269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508904
41	NC_014026	ACG	2	6	2291	2296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508904
42	NC_014026	CGA	2	6	2332	2337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508904
43	NC_014026	CGC	2	6	2444	2449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508904
44	NC_014026	AGC	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508904
45	NC_014026	AGG	2	6	2592	2597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294508904
46	NC_014026	ACC	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294508904
47	NC_014026	CAGG	2	8	2674	2681	25 %	0 %	50 %	25 %	294508904
48	NC_014026	TGA	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294508904
49	NC_014026	GCG	2	6	3230	3235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508905
50	NC_014026	AGC	2	6	3323	3328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508905
51	NC_014026	GCC	2	6	3375	3380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508905
52	NC_014026	GA	3	6	3405	3410	50 %	0 %	50 %	0 %	294508905
53	NC_014026	CGC	2	6	3546	3551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508905
54	NC_014026	CTC	2	6	3559	3564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294508905
55	NC_014026	AGC	2	6	3599	3604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508905
56	NC_014026	CGA	2	6	3684	3689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508905
57	NC_014026	GAC	2	6	3691	3696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508905
58	NC_014026	CGA	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508905
59	NC_014026	CGC	2	6	3723	3728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508905
60	NC_014026	GGACCC	2	12	3820	3831	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294508906
61	NC_014026	CTC	2	6	3845	3850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294508906
62	NC_014026	ACC	2	6	3902	3907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294508906
63	NC_014026	GCCC	2	8	3973	3980	0 %	0 %	25 %	75 %	294508906
64	NC_014026	CGG	2	6	4042	4047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508906
65	NC_014026	AGG	2	6	4116	4121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294508906
66	NC_014026	CCG	2	6	4140	4145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508906
67	NC_014026	GCC	2	6	4166	4171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508906
68	NC_014026	CGG	2	6	4222	4227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508906
69	NC_014026	TCG	2	6	4233	4238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294508906
70	NC_014026	GGTT	2	8	4265	4272	0 %	50 %	50 %	0 %	294508906
71	NC_014026	AGGTGA	2	12	4311	4322	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	294508906
72	NC_014026	CACCGA	2	12	4420	4431	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294508906
73	NC_014026	GAC	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508906
74	NC_014026	TCG	2	6	4597	4602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294508907
75	NC_014026	TCG	2	6	4620	4625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294508907
76	NC_014026	GGAG	2	8	4679	4686	25 %	0 %	75 %	0 %	294508907
77	NC_014026	CGCC	2	8	4693	4700	0 %	0 %	25 %	75 %	294508907
78	NC_014026	GA	3	6	4717	4722	50 %	0 %	50 %	0 %	294508907
79	NC_014026	CGC	2	6	4725	4730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508907
80	NC_014026	ACG	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508907
81	NC_014026	AGG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294508907
82	NC_014026	GAA	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294508907
83	NC_014026	GAC	2	6	5148	5153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508907
84	NC_014026	TTTGG	2	10	5179	5188	0 %	60 %	40 %	0 %	294508907
85	NC_014026	GAC	2	6	5241	5246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508907
86	NC_014026	CGG	2	6	5373	5378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508908
87	NC_014026	CT	3	6	5401	5406	0 %	50 %	0 %	50 %	294508908
88	NC_014026	ACT	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294508908
89	NC_014026	GAG	2	6	5433	5438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294508908
90	NC_014026	CAC	2	6	5439	5444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294508908
91	NC_014026	GGT	2	6	5450	5455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294508908
92	NC_014026	GGA	2	6	5591	5596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294508908
93	NC_014026	CCG	2	6	5642	5647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508908
94	NC_014026	GGC	2	6	5726	5731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508908
95	NC_014026	GGC	2	6	5807	5812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508908
96	NC_014026	GGC	2	6	5828	5833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508908
97	NC_014026	GAG	2	6	5877	5882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294508908
98	NC_014026	GCC	2	6	5886	5891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508908
99	NC_014026	AGC	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508908
100	NC_014026	GCT	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294508908
101	NC_014026	CCG	2	6	5921	5926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508908
102	NC_014026	AGA	2	6	5963	5968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294508908
103	NC_014026	TCA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294508908
104	NC_014026	CTTC	2	8	6145	6152	0 %	50 %	0 %	50 %	294508909
105	NC_014026	CGGT	2	8	6187	6194	0 %	25 %	50 %	25 %	294508909
106	NC_014026	GAA	2	6	6195	6200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294508909
107	NC_014026	TGA	2	6	6206	6211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294508909
108	NC_014026	TCA	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294508909
109	NC_014026	ACG	2	6	6253	6258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508909
110	NC_014026	CGG	2	6	6292	6297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508909
111	NC_014026	GCC	2	6	6363	6368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508909
112	NC_014026	CGG	2	6	6374	6379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508909
113	NC_014026	CGG	2	6	6383	6388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508909
114	NC_014026	CGA	2	6	6429	6434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508909
115	NC_014026	TTC	2	6	6442	6447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294508909
116	NC_014026	GCC	2	6	6484	6489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508909
117	NC_014026	CAG	2	6	6646	6651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508909
118	NC_014026	GGA	3	9	6687	6695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294508909
119	NC_014026	CG	3	6	6784	6789	0 %	0 %	50 %	50 %	294508910
120	NC_014026	GGC	2	6	6795	6800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508910
121	NC_014026	CGG	2	6	6830	6835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508910
122	NC_014026	GCCCG	2	10	6875	6884	0 %	0 %	40 %	60 %	294508910
123	NC_014026	GCC	2	6	6978	6983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508910
124	NC_014026	CTT	2	6	6989	6994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294508910
125	NC_014026	GGC	2	6	7001	7006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294508910
126	NC_014026	CGC	2	6	7052	7057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508910
127	NC_014026	AGACCC	2	12	7117	7128	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294508910
128	NC_014026	GAC	2	6	7165	7170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508911
129	NC_014026	GCC	2	6	7270	7275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508911
130	NC_014026	GCC	2	6	7291	7296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508911
131	NC_014026	GCGCAG	2	12	7306	7317	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	294508911
132	NC_014026	GCC	2	6	7393	7398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294508911
133	NC_014026	GCA	2	6	7492	7497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294508911
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208	NC_014026	GT	3	6	10997	11002	0 %	50 %	50 %	0 %	294508915

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.